Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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LAMA3Q16787 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
LAMA3Q16787 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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LAMA3Q16787 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
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LAMA3Q16787 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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LAMA3Q16787 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
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LAMA3Q16787 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
LAMA3Q16787 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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