Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HIF1AQ16665 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HIF1AQ16665 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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