Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL512303.1-201ENST00000458693 465 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
CTF1Q16619 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.5 ms