Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SGCAQ16586 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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SGCAQ16586 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SGCAQ16586 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SGCAQ16586 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
SGCAQ16586 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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SGCAQ16586 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
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SGCAQ16586 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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SGCAQ16586 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SGCAQ16586 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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