Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
SGCBQ16585 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms