Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SNAPC1Q16533 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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