Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GABRA6Q16445 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms