Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA4Q16363 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.53□□□□□ -2
LAMA4Q16363 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
LAMA4Q16363 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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