Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
ITSN1Q15811 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ITSN1Q15811 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms