Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
TAF1AQ15573 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TAF1AQ15573 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms