Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHD4Q14839 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms