Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SMCO1Q147U7 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.4 ms