Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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COL9A3Q14050 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COL9A3Q14050 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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