Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CACNA1SQ13698 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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