Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HDAC1Q13547 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HDAC1Q13547 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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