Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
ATRQ13535 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
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