Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
SNTA1Q13424 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms