Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
NME3Q13232 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NME3Q13232 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
NME3Q13232 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
NME3Q13232 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
NME3Q13232 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
NME3Q13232 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154 ms