Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.55□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms