Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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CBX3Q13185 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CBX3Q13185 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CBX3Q13185 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
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CBX3Q13185 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
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CBX3Q13185 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
CBX3Q13185 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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