Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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CHAF1BQ13112 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CHAF1BQ13112 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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