Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
CHAF1AQ13111 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHAF1AQ13111 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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