Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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IFT88Q13099 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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IFT88Q13099 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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IFT88Q13099 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
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IFT88Q13099 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
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IFT88Q13099 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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IFT88Q13099 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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IFT88Q13099 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
IFT88Q13099 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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