Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TROQ12816 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TROQ12816 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
TROQ12816 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
TROQ12816 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TROQ12816 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TROQ12816 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TROQ12816 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TROQ12816 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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