Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHRNEQ04844 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms