Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERFP50548 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ERFP50548 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ERFP50548 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ERFP50548 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ERFP50548 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ERFP50548 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ERFP50548 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ERFP50548 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ERFP50548 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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