Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRGP23470 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRGP23470 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms