Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Mbd2Q9Z2E1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms