Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cacna2d3Q9Z1L5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms