Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Shcbp1Q9Z179 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Shcbp1Q9Z179 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms