Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLDN16Q9Y5I7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms