Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CASP8AP2Q9UKL3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CASP8AP2Q9UKL3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms