Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rnf4Q9QZS2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf4Q9QZS2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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