Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChmQ9QXG2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ChmQ9QXG2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms