Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trpc4apQ9JLV2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms