Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Irx5Q9JKQ4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Irx5Q9JKQ4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms