Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim39Q9ESN2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms