Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB27

Mcts1, Malignant T-cell-amplified sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcts1Q9DB27 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mcts1Q9DB27 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mcts1Q9DB27 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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