Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sh2d4aQ9D7V1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh2d4aQ9D7V1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms