Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nudt21Q9CQF3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms