Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ska1Q9CPV1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ska1Q9CPV1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 481.1 ms