Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Prpf19Q99KP6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms