Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sh3bgrl3Q91VW3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sh3bgrl3Q91VW3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms