Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pitrm1Q8K411 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms