Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT0

Aldh4a1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Aldh4a1Q8CHT0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Aldh4a1Q8CHT0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms