Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc43a2Q8CGA3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc43a2Q8CGA3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms