Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apol7cQ8C6E1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms