Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Amigo3Q8C2S7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms