Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sdc3Q64519 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sdc3Q64519 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms