Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
FRMPD1Q5SYB0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FRMPD1Q5SYB0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms